Para atingir os seus objectivos, a Sociedade promove, de acordo com as prioridades estabelecidas pelos seus órgãos, iniciativas como:
- a realização de reuniões científicas;
- a publicação do seu Jornal, "Jornal da Sociedade das Ciências Médicas de Lisboa;
- a organização de conferências e de cursos especializados;
- a manutenção de uma biblioteca;
- a atribuição de prémios científicos;
- o estreitamento de relações com as suas congéneres nacionais e estrangeiras;
- o fomento e desenvolvimento do intercâmbio cultural e científico entre pessoas interessadas na Medicina.